De bemanning van de PHYVIR-expeditie aan boord van het onderzoeksschip Anna Weber - van Bosse.

De bemanning van de PHYVIR-expeditie aan boord van het onderzoeksschip Anna Weber - van Bosse.

Fytoplankton, microscopisch kleine organismen in de oceaan, produceert ongeveer de helft van de zuurstof op aarde en speelt een cruciale rol in de wereldwijde koolstofkringloop. Toch is er nog maar weinig bekend over hun interacties met virussen en de gevolgen daarvan voor de gezondheid van de oceanen en het klimaat. Het PHYVIR-project wil hier verandering in brengen door laboratoriumonderzoek, oceaanexpedities en geavanceerde modellen te combineren.

In deze blogserie volgen we het onderzoek op zee aan boord van de RV Anna Weber-van Bosse. Van de voorbereidingen in de haven tot de eerste metingen in de Atlantische Oceaan: we nemen je mee achter de schermen van het leven en de wetenschap aan boord.

RV Anna Weber - van Bosse tijdens de PHIVIR-expeditie (video: NIOZ)

31 mei - Ervaring met het nieuwe schip

Door Corina Brussaard (senior onderzoeksleider)

Dit was de eerste lange wetenschappelijke expeditie met het nieuwe schip – in het begin hield ik mijn vingers gekruist. Ik hoopte dat het nieuwe schip niet al te veel kinderziektes zou hebben en dat onze expeditietijd niet zou worden ingekort of zelfs geannuleerd. Het zag er goed uit, iedereen was tevreden! Toen kwam het nieuws dat luchtvaartmaatschappijen het aantal vluchten begonnen te verminderen vanwege de hoge kerosineprijzen. We maakten grapjes dat het schip weliswaar Mindelo, Kaapverdië (de vertrekhaven) zou halen, maar dat wij er niet zouden zijn. Gelukkig pakte ook dat goed uit en kwamen we allemaal op tijd aan om aan boord te gaan.  

Eenmaal aan boord waren er allerlei problemen – wat een stressvolle start! Maar we hebben het gered (de bemanning verdient een enorme pluim!) en daar gingen we. Een nieuw schip en een grote groep wetenschappers, van wie velen nog nooit eerder hadden gevaren. We hadden geluk met het weer in het begin, en dat is sindsdien zo gebleven, gezien het feit dat het lente is en we naar IJsland varen. We hadden af en toe stormachtige wind en hoge golven, maar nooit lang. We hadden het grootste deel van de reis de wind in de rug, wat ook een groot verschil maakt, omdat het schip dan soepeler vaart. 

Omdat ik al op verschillende schepen heb gevaren, maar vooral op de voormalige RV Pelagia, heb ik vergeleken hoe dit nieuwe schip zich gedraagt. Ik moet zeggen dat het wat meer schommelt, maar al met al vaart het erg goed. En niet alleen het schip zelf is nieuw, maar ook de indeling en de instrumenten. We raakten sneller gewend aan de indeling dan ik had verwacht. We maken goed gebruik van alle scheepslaboratoria en de vier extra temperatuur gecontroleerde labcontainers. We moeten immers werken bij de temperatuur waarbij de algen groeien. Daarom hebben we de temperatuur in de containers al aangepast met 15 graden Celsius, van 23 °C vlak na vertrek tot 9 °C nu we IJsland naderen. Draag laagjes en pak je jassen in. 

En nogmaals, we hebben geluk dat het tot nu toe niet veel heeft geregend. Dat maakt het werk zoveel makkelijker. We hebben bij voorkeur watermonsters nodig met een laag ijzergehalte (zie eerdere blogs) en gebruiken daarom de ultra zuivere CTD. Deze gaat in een container voor verdere bemonstering, dus degenen die daarin werken blijven droog, maar degene die buiten staat om lege flessen aan te reiken en gevulde flessen mee te nemen, niet. Door de toegenomen wind en golven van de afgelopen dagen konden we de ultra zuivere CTD niet gebruiken en hebben we bemonsterd met de ‘standaard’ CTD van het schip. Deze staat niet langer buiten (zoals op het vorige schip) wanneer hij gevuld is met watermonsters, maar wordt naar binnen gebracht. Dat is luxe! 

De wetenschappelijke groep groeide al snel uit tot een groot team en er is altijd wel iemand bereid om iemand anders te helpen. Een paar sociale evenementen en hier en daar een spelletje of film doorbreken de routine. Routine is goed voor de wetenschap, maar niet altijd even goed voor ons!

We kijken uit naar de laatste stations en nu al naar de PHYVIR-2-expeditie in de zomer van 2027 op de RV Anna Weber-van Bosse. Bedankt voor het volgen van onze blogs deze maand! 

Het wetenschapsteam in het drooglab aan boord

Team effort in het drooglab

29 mei - Natuurwaarnemingen

Naomi Bakken (PhD student) 

“Big fish!” roept een van de bemanningsleden vanaf het C-dek. Een donderend geluid van veiligheidsschoenen klinkt terwijl we vanaf onze bemonsteringslocaties de trap op rennen om te kijken wat hij bedoelt. We zijn nu achttien dagen onderweg en de afgelopen week werden we al een paar keer geprikkeld door veel te korte glimpen van walvissen – waterfonteinen en slechts de ronding van een rug. Terwijl we over de reling turen, rollen een tiental zwarte walvisachtigen gracieus over het wateroppervlak, enkele tientallen meters verderop. Sven vertelt ons dat het grienden zijn. Tot onze vreugde zien we de komende dagen meerdere keren groepen van deze walvissen, een keer met twee jongen op slechts enkele meters van ons schip, die soms een paar uur in de buurt blijven. 

In de weken daarvoor waren waarnemingen van mariene macrofauna schaars. Tijdens de lunch op onze eerste zeildag stond Liam op en wees naar dolfijnen buiten het raam die naast het schip zwommen. Dedmer nam de volgende dagen zijn plaats in aan de voorkant van het schip en zag nog meer dolfijnen speels op de boeggolf rijden. In de voedselarme gebieden tussen Kaapverdië en de Azoren was onze belangrijkste natuurwaarneming de prachtige, kleine Portugese oorlogsschipkwal. Helaas zagen we ook stukjes plastic voorbij drijven. 

Portugees oorlogsschip (kwal) drijft langs

Portugees oorlogsschip (kwal). Foto: Dedmer van de Waal

Tijdens de maaltijden dromen we over wat de volgende dag ons zal brengen. “Bultruggen die vlak voor de boot boven water komen.” “En er is een kalf bij!” “Als we naar de andere kant van het schip kijken, zie je een blauwe vinvis water uit zijn blaasgat spuiten.” “En er zwemt een groep orka’s voorbij, met zalmhoedjes op.” We leggen allemaal onze wensen voor aan het universum. Het recente nieuws dat we tijd hebben om verder naar het noorden te reizen (ten westen van IJsland) voor het laatste bemonsteringsstation, doet ons allemaal hopen op orka-waarnemingen. 

Zeezoogdieren zijn niet de enige bron van vreugde aan boord. We hebben een paar fervente vogelaars, Karein en Dedmer. Verrekijkers zijn altijd bij de hand, hangend in onze labcontainers en om de nek als we op het dek zijn. Een paar dagen na het verlaten van Kaapverdië merkten een paar mensen een kleine mus op die rond het schip fladderde. We speculeerden dat hij misschien aan het liften was. Rond de Azoren zagen we hem niet meer en hoopten we dat hij zijn weg terug naar het vasteland had gevonden. Toen we nog in de wateren van Kaapverdië waren, hadden we een geweldig uitzicht op een bruine jan-van-gent die voor de boeg van de boot rondhing. Op 23 mei zagen we een Amerikaanse torenvalk, een vogel die je maar zelden ziet! Nu we dichter bij IJsland komen, zien we meer noordelijke stormvogels die ons nu elke dag gezelschap houden.  

Bruine jan van gent aan dek

Bruine jan-van-gent. Foto: Dedmer van de Waal

Als microbiologen vinden we het natuurlijk ook leuk om een glimp op te vangen van de organismen die we bestuderen: fytoplankton! Corina of Hisham preparen elke dag zeewatermonsters, zodat we ze onder de microscoop kunnen bekijken. De samenstelling van de geconcentreerde watermonsters verschilt van dag tot dag, wat elke keer weer voor spannende verrassingen zorgt. Onlangs gezien: Dinophysis, een fytoplanktonsoort die verantwoordelijk is voor schadelijke algenbloei (potentieel giftig), en de diatomee (met glasachtige frustule) soort Pseudo-nitzschia, en een verrassende coccolithofoorbloei (fytoplankton met calciumcarbonaatschubben aan de buitenkant). En elke keer als er een roeipootkreeft (volwassen of jong) voorbij zoeft, is dat reden voor opwinding: “Roeipootkreeft!!”. Dit schattige zoöplankton was zelfs de inspiratiebron voor een verhaal dat Eva schreef tijdens de Talent Event-avond. 

Een geconcentreerd watermonster met verschillende soorten fytoplankton onder de microscoop

Een geconcentreerd watermonster met verschillende soorten fytoplankton

een roeipootkreeftje onder de microscoop

Een roeipootkreeftje. Foto’s: Naomi Bakken

28 May- Beyond the science

Door Lea Simons (PhD student Universiteit Groningen)

Er wordt aan boord veel wetenschappelijk onderzoek gedaan, maar dat is natuurlijk niet het enige wat er gebeurt. Naast hard werken is er ook tijd voor gezelligheid na het werk.

BBQ na werktijd 

Toen het weer en de golven nog goed waren, hadden we de geweldige kans voor een “gezellige” BBQ! Er werd rekening gehouden met alle dieetwensen, het was echt een feestmaal als geen ander. Verse salades en meer keuzes dan je kon tellen, variërend van verse zeevruchten, gemarineerd vlees, bietenburgers en vegetarische grillgerechten. We genoten natuurlijk ook van de tropische zonsondergang! En leuke muziek, wat karaoke en dansen.

Cruisequiz

Natuurlijk konden we een pubquiz over de cruise en het maritieme thema niet overslaan! Eva en Emma, twee masterstudenten (van de Universiteit van Amsterdam) aan boord, bedachten vragen die ons meenamen van de geografie van landen die we tijdens onze cruise passeerden, naar muziekvragen en raadsels over zeedieren. Naast de vragen kon het team met de meest fantasierijke naam een bonuspunt winnen. De keuze was moeilijk. We hadden Dirty Drifters, Algae’s Angels, Virus Pirates, Barbrainians, Creative Talented Dreamers (CTD) en Crapeaha (Cracker, Peanut Butter, Hagelslag). Aan wie zou jij het punt hebben toegekend? Emma en Eva besloten dat de Barbrainians de eer zouden krijgen. Uiteindelijk hebben de Virus Pirates ons echter allemaal verpletterd met hun kennis! 

To be or not to be… 

Er zijn moordenaars aan boord! We zijn begonnen aan een meerdaags Assassin-spel vol verraderlijke moorden. Elke speler krijgt een kaart en een voorwerp waarmee hij of zij iemand moet vermoorden (met een zacht tikje natuurlijk) zonder dat er getuigen bij zijn, zorgvuldig uitgekozen door onze aangestelde spelleider Melle. Niet spelen tijdens het werk. Het spel is vooral grappig omdat de gekozen voorwerpen dicht bij de hand moeten worden gehouden voor het geval het juiste moment voor een moord zich voordoet, wat ertoe leidt dat mensen rondlopen met onder andere pingpongbatjes, bezems, emmers en kussens. Er werden allianties gesmeed, niet-spelers hielpen spelers, er werden waarschuwingen verspreid en informatie uitgewisseld tussen de doden en de levenden… en het wantrouwen groeide! Sommigen kozen voor de voor de hand liggende aanvallen, terwijl anderen stille moordenaars waren. Zich verstoppen achter deuren, hun slachtoffers weg lokken uit de menigte, wachten tot iemand een monster verwisselde in de flowcytometer – inderdaad wreed. Iedereen wachtte geduldig tot de moorden zich ontvouwden, zodat we konden ontdekken wie er als laatste overbleef. 

Anna Weber’s Got Talent

Met zoveel verschillende mensen aan boord zijn er ook veel talenten in de buurt. Het Anna Weber’s Got Talent-evenement was de perfecte manier om onze vaardigheden te laten zien – hoe goed (of slecht) die ook mogen zijn! Dedmer (onderzoeker) leidde als presentator de avond en stelde al onze deelnemers voor. Om te beginnen lieten Emma en Karein (twee masterstudenten van de Universiteit van Amsterdam en de Universiteit van Groningen) ons kennismaken met ‘Wat kinderen op zaterdagavond uitspoken’, waarbij we een reeks minispelletjes speelden die onze competitieve kant naar boven haalden. Vervolgens kreeg eerste stuurman Meile, die zijn doe-het-zelfvaardigheden demonstreerde met een kartonnen doos op zijn hoofd, hilarisch applaus van alle deelnemers! Daarna toonde Eva (masterstudent aan de Universiteit van Amsterdam) haar creatieve schrijfvaardigheid door een verhaal te delen over Kevin de Copepod en zijn weg naar roem aan boord van de Anna Weber-van Bosse – we willen de gedrukte versie! Vervolgens, vlak voor de pauze, waren er onze speciale gasten die de hele avond in de VIP-hoek op hun grote moment hadden gewacht – Without Temptation! Ze speelden hun nieuwste single “Heave up the CTD frame”, die een vreemd vertrouwd deuntje had… het had een shanty-cover van “Drunken Sailor” kunnen zijn, maar wie zou deze legendes durven beschuldigen van plagiaat! Daarna was het de beurt aan Yael (onderzoeker) en haar creatieve workshop “Running Ants”. Terwijl we de beroemde Escher “Mobius Strip II” verkenden, leerden we wat er gebeurt als je deze vorm doormidden en in drieën snijdt… probeer het thuis eens! Daarna droeg onze hoofdwetenschapper Corina een gedicht voor dat ze had geschreven over alle cruisedeelnemers, waarbij ze de nadruk legde op opvallende persoonlijkheidskenmerken, alle hoeksteenrollen benadrukte en het harde werk van iedereen aan boord prees. Vervolgens liet Liam (masterstudent aan de Universiteit van Utrecht) zijn ‘devil sticks’-trucs zien, terwijl hij grappen vertelde die ons in een hysterische lachbui brachten. De afsluiting van de avond was weer een muzikaal optreden, waarbij we de wereld van de rap betraden met Run-CTD en hun nieuwe hit die toevallig helemaal over virale oceaanwetenschap ging – vreemd genoeg heel toepasselijk voor het publiek!

Het ongeplande…

Naast de georganiseerde activiteiten doen we nog veel meer om tot rust te komen. We hebben een puzzeltafel naast onze flowcytometers neergezet om aan het eind van de dag even te ontspannen tussen het verwerken van monsters door, vooral met wat fijne achtergrondmuziek om tot rust te komen. Overdag hebben we ook de mogelijkheid om wilde dieren te spotten; velen hebben dan altijd een verrekijker om hun nek hangen. De meeste van onze sociale activiteiten vinden 's avonds plaats. Na onze avondbijeenkomsten om 19.00 uur, als er geen werk meer te doen is, blijven velen van ons achter in de lounge voor spontane spelletjesavonden (waarbij Catan de laatste tijd een populaire keuze is, hoewel de golfslag het bord regelmatig herschikt). Soms kijken we films, of houden we meedogenloze pingpong- en tafelvoetbaltoernooien, of komen we tot rust met creatieve activiteiten zoals breien en tekenen. De activiteiten op de cruise gaan dus zeker verder dan alleen de wetenschap!

4 fotos van vrije tijd aan boord van de PHYVIR cruise

Vrije tijd aan boord tijdens de PHYVIR cruise

27 May - Drifting traps

Blog geschreven door Hisham Shaikh (Post-doc NIOZ)

Om de laatste week van de PHYVIR-I-expeditie af te trappen, hebben we de vierde — en laatste — drifting trap van de expeditie opgehaald. We konden dit apparaat lenen van onze NIOZ-collega Jan-Berend Stuut en het vormt een interessante aanvulling op onze onderzoeksexpeditie door de Noord-Atlantische Oceaan. Dorien Hoexum en ik vonden het erg leuk om met deze vallen te werken, maar we waren niet de enigen: het ophalen van de vallen trok meestal wel wat publiek. Mensen pauzeerden even en waren nieuwsgierig naar de kleine dieren die af en toe in de vallen terechtkwamen. Bij deze laatste ophaling kregen we echter wel heel bijzondere bezoekers. Een groep langvin-grienden, waaronder minstens twee kalveren, naderde het schip met duidelijke nieuwsgierigheid. Het was de dichtste nadering van deze walvissen tot ons drijvende huis, het onderzoeksschip RV Anna Weber-van Bosse, tijdens de afgelopen weken. Een ongelooflijk bijzonder afscheid terwijl we de laatste vallen uit de oceaan haalden.

een foto van drfting traps die op zee worden binnengehaald, met grienden

De vangbuizen worden binnengehaald met onverwachte bezoekers: een school grienden. (Foto: Hisham Shaikh)

Wat zijn drifting traps precies en waarom hebben we ze uitgezet?

Drifting traps bestaan uit een reeks buizen op verschillende dieptes die zinkende deeltjes uit het door zonlicht doordrongen oppervlaktewater opvangen. Tijdens deze expeditie hebben we vier drifting traps uitgezet, elk met buizen op een diepte van 100, 200 en 400 meter. Terwijl de deeltjes door de oceaan zinken, worden ze in deze buizen opgevangen. Ons doel is te begrijpen hoe virussen het zinken van fytoplankton kunnen beïnvloeden, dat de basis vormt van mariene voedselketens en een belangrijke rol speelt bij het verwijderen van kooldioxide uit de atmosfeer. Door zinken of sedimentatie wordt deze koolstof naar de diepten van de oceaan getransporteerd. Tijdens hun afdaling worden deze deeltjes ook afgebroken, waardoor uiteindelijk slechts een zeer klein percentage de zeebodem bereikt. We bepalen het zinkpotentieel van de verschillende fytoplanktonpopulaties (zie eerdere blog van Li Zhao) en de drijvende vallen zijn daar een logisch vervolg op. Aangezien er aanwijzingen zijn dat sommige fytoplanktongroepen de neiging hebben om zich te aggregeren bij een virale infectie, willen we specifiek onderzoeken welk fytoplankton in deze zinkende aggregaten te vinden is.

Drifting traps aan de oppervlakte

Het drijvende deel van de drifting traps (foto: Hisham Shaikh)

In sommige buisjes worden de kwetsbare aggregaten in een gel op de bodem van het buisje bewaard, zodat we hun vorm en abundantie kunnen bestuderen. Andere buisjes worden gebruikt voor zogenaamde bulkmeteringen van: de abundantie en genetische samenstelling van fytoplankton, bacteriën en virussen; de totale concentratie van chlorofyl; en de transparante exopolymeerdeeltjes (TEP) die een kleverige voorloper van aggregaten vormen en ervoor zorgen dat deze sneller zinken. Door het DNA en RNA uit de vallen te sequencen, willen we achterhalen welke virussen deze zinkende fytoplanktongemeenschappen infecteren, en hoe deze microscopische interacties het vermogen van de oceaan om koolstof op te slaan in de diepzee kunnen beïnvloeden.

Een diagram van drijvende vallen en gels met aggregaten die op 100 m, 200 m en 400 m diepte in de Noord-Atlantische Oceaan zijn verzameld. (Foto: Hisham Shaikh)

Een schema van drijvende vallen en gels met aggregaten die op 100 m, 200 m en 400 m diepte in de Noord-Atlantische Oceaan zijn verzameld. (Foto: Hisham Shaikh)

25 mei - Riemen vast!

Blog door Thomas Cupido (Msc-student RUG) en Melle Versluis (PhD-student PHYVIR)

Rollen in bed en schuivende borden 

Na tweeëntwintig prachtige dagen moeten we eraan geloven: het weer op de noordelijke oceaan is aanzienlijk verslechterd. De wind is flink toegenomen, waardoor we golven tot wel zes meter hoog hebben gehad. Gelukkig is de Anna Weber-van Bosse gebouwd voor dit soort omstandigheden, maar de wetenschappers moeten hun zeebenen weer even boven water halen.

De golven maken onze dagelijkse activiteiten ineens een stuk uitdagender. Tijdens het eten moeten we ons goed schrap zetten met onze benen en moeten we ons bord met één hand vasthouden. Dit maakt eten een stuk lastiger, maar ook hier zijn we weer snel aan gewend. Tijdens ons dagelijkse potje pingpong brengen de golven ook weer een extra dimensie, maar dit maakt het alleen maar leuker. Daarnaast is in slaap vallen soms ook een uitdaging, omdat de golven ervoor zorgen dat je door je bed rolt. Gelukkig houden de stuurmannen hier rekening mee door ’s nachts een iets andere koers te varen. Dat is ook terug te zien in onze route.

Het weer doet wat het wil 

Het weer heeft ook invloed op de manier waarop we onderzoek kunnen doen. Alles moet vastgeknoopt worden en tijdens het werk moet je je goed schrap zetten. Daarnaast heeft het ook impact op de manier waarop we het water bemonsteren. Elke ochtend wachten we af op het oordeel van de kapitein en onze research leader, Corina. Gaan de werkzaamheden door zoals gewoonlijk of wordt het plan aangepast?

Als de golven te groot zijn wordt de crew geïnstrueerd en de onderzoekers weten direct wat er gaat gebeuren. In plaats van de clean CTD (UCC) gaan we aan bakboord aan de slag met onze rosette CTD. Doordat deze CTD bij het schip hoort en niet in een speciale container hoeft kunnen we langer doorgaan bij verslechterend weer en brengt deze minder risico’s met zich mee tijdens het takelen. Een bijkomend voordeel is dat iedere onderzoeker direct zijn eigen samples kan nemen, waardoor het proces een stuk sneller verloopt.

Je vraagt je misschien af waarom we deze CTD dan niet altijd gebruiken. De belangrijkste reden is dat deze CTD ijzeren componenten bevat, wat mogelijk tot besmetting van de samples kan leiden. Gelukkig kan een heel groot deel van de metingen gewoon doorgaan met de “normale” CTD waardoor we alsnog een hele hoop belangrijke informatie vergaren over deze noordelijkere wateren. En door de menging verwachten we hier ook niet meer een (sterke) ijzerlimitatie.

De CTD aan boord is goed gezekerd zodat hij niet kan verschuiven

De CTD is gezekerd tegen de golven (foto: NIOZ)

Materiaal aan boord is gezekerd tegen de golven

Onderzoek doen aan boord vereist soms extreme maatregelen (foto: NIOZ)

21 mei - Naar beneden zinken in zee

Fytoplankton drijft niet altijd

Marien fytoplankton maakt slechts 1% uit van de wereldwijde biomassa, maar deze minuscule organismen dragen bij aan ongeveer de helft van de primaire productie op aarde. Hun naam zegt het al (fytoplankton; van het Griekse phyto voor plant en planktos voor zwerver/drijver); ze drijven meestal rond in de oppervlaktelaag van de oceaan, waar ze fotosynthese verrichten. Dat is echter niet altijd het geval. Ze kunnen ook naar de diepere oceaan zinken en zelfs de zeebodem bereiken. Dit heeft een grote invloed op belangrijke processen van de mondiale biogeochemische cyclus en draagt direct bij aan koolstofopslag.

Fytoplankton zinkt om verschillende redenen. Sommige zijn gewoon groot en zwaar, zoals grote diatomeeën die een glasachtig huisje hebben om zich te beschermen. En hoewel ze hun drijfvermogen tot op zekere hoogte kunnen reguleren, kunnen ze, wanneer de waterkolom minder gemengd raakt, uit de door de zon verlichte bovenste oceaan zinken. De meeste diatomeeën produceren ook transparante exopolymeerdeeltjes (TEP), de voorloper van aggregaatvorming. Onlangs is aangetoond dat een virale infectie dit proces versterkt en dat cellen dan eerder collectief zinken. Tijdens de huidige expeditie willen we achterhalen wie er zinken, hoe snel ze zinken en onderzoeken of een virale infectie het zinken van fytoplankton cellen versterkt.

SETCOLs aan boord

Om deze vragen te beantwoorden, maken we aan boord gebruik van SETCOL-testen en zetten we drijvende vallen uit (daarover later meer in een andere blog). SETCOL is de afkorting van ‘settling column’, een doorzichtige verticale cilinder die we vullen met zeewater en een paar uur bij kamertemperatuur laten hangen. De kolom heeft drie afsluiters: één enkele centimeters onder de bovenkant (3% van het totale volume; om te bepalen of cellen drijven), één op ongeveer 10 centimeter van de bodem (88% van het totale volume) en de laatste op de bodem (9% van het totale volume; om te bepalen of cellen zijn gezonken). 

SETCOLs worden voornamelijk gebruikt in laboratoriumonderzoek, waar ze stil kunnen staan. Om het bezinken aan boord uit te voeren, moeten we de invloed van de scheepsbewegingen overwinnen, anders worden bezonken cellen gemakkelijk weer in suspensie gebracht. Dankzij de NMF-werkplaats (National Marine Facilities) bij NIOZ konden we aan boord gaan met zes SETCOLs die zijn aangepast aan de omstandigheden tijdens de expeditie. Ze zijn ontworpen om vrij mee te bewegen met de scheepsbewegingen, wat betekent dat ze perfect verticaal kunnen blijven staan. Dit creëert een stabiele omgeving waarin het fytoplankton kan bezinken, vrijwel geheel ongehinderd door de golven.

Eerste indruk van de resultaten

Om te voorkomen dat de kwetsbare cellen beschadigd raken of onder stress komen te staan, zuigen we het water voorzichtig via slangen in de kolommen in plaats van het erin te gieten. Na zes uur bezinken laten we de drie secties leeglopen, waarbij we de onderste als laatste leegmaken zodat deze ongestoord blijft. We nemen monsters van de fytoplanktonsamenstelling in elk van de secties van de SETCOL, waarbij we de verschillende fytoplanktonpopulaties tellen, maar ook hun identiteit (en die van de virussen erin) bepalen met behulp van genetische technieken in het thuislaboratorium. Verder nemen we monsters voor TEP en aggregaten. Het tellen aan boord (met behulp van flowcytometrie) levert nu al spannende aanwijzingen op: sommige van de grotere fytoplanktongroepen zinken. We kijken uit naar de rest van de expeditie en alle resultaten.

 

21 mei – Voelen de cellen zich goed?

Geschreven door Xiaonan Cai (promovendus bij NIOO)

Kleine cellen, grote aanwijzingen

De oceaan zit vol met fytoplankton. Deze minuscule organismen vormen de basis van mariene voedselketens en helpen bij het opnemen van CO₂ uit de atmosfeer. Maar fytoplankton is niet allemaal hetzelfde: verschillende soorten hebben verschillende afmetingen, vormen en manieren om licht en voedingsstoffen te gebruiken.

Hierdoor kunnen fytoplanktongemeenschappen sterk verschillen van de ene plek tot de andere. Een gemeenschap in warme, voedselarme subtropische wateren kan er heel anders uitzien dan een in koudere, voedselrijke subpolaire wateren. Tijdens onze transect over de Noord-Atlantische Oceaan van zuid naar noord is een van de vragen die ons interesseert: hoe gezond zijn deze fytoplanktoncellen, en verandert hun fotosynthetisch vermogen en cellulaire samenstelling onderweg, en houdt dat verband met externe oorzaken zoals veranderingen in omgevingsomstandigheden of virale infecties?

Fytoplanktoncellen bevatten chemische aanwijzingen die ons helpen dit te ontcijferen. Een belangrijke aanwijzing is de elementaire stoichiometrie: de balans van koolstof, stikstof en fosfor in de cellen, vaak weergegeven als de verhouding C:N:P. Deze elementen zijn essentieel voor groei, metabolisme en energieoverdracht. Wanneer de C:N:P-balans verschuift, kan dit erop wijzen dat cellen zich aanpassen aan hun omgeving, te maken hebben met nutriëntenstress of hun groeipatroon veranderen.

Dit is ook belangrijk voor het begrijpen van de interacties tussen fytoplankton en virussen. Als parasieten zijn virussen voor hun voortplanting afhankelijk van hun gastheren, dus de toestand van de gastheer kan van invloed zijn op het succes van de productie van nieuwe virusdeeltjes. Een cel die onder voedingsstress staat, levert mogelijk niet dezelfde middelen als een gezonde cel.

Gezondheid in verschillende grootteklassen

Fytoplankton wordt vaak ingedeeld in verschillende grootteklassen: microfytoplankton is ongeveer 20–200 µm, nanofytoplankton ongeveer 3–20 µm en picofytoplankton 0,3–3 µm. Deze grootteklassen reageren niet altijd op dezelfde manier op omgevingsstressoren. Kleinere cellen doen het vaak goed, zelfs in voedselarme wateren, omdat ze efficiënt zijn in het opnemen van voedingsstoffen, terwijl grotere cellen talrijker kunnen worden wanneer er meer voedingsstoffen beschikbaar zijn.

Tijdens de expeditie verzamelen we zeewater en filteren we dit stap voor stap door filters met verschillende poriëngroottes. Zo kunnen we de fytoplanktongemeenschap in deze verschillende groottefracties scheiden. Soms geeft de filtratie zelf al een eerste indruk van het water: als de filters snel verstopt raken en het water er heel langzaam doorheen stroomt, zit er waarschijnlijk meer deeltjesmateriaal in, waaronder fytoplanktonbiomassa. Later, terug in het laboratorium, analyseren we de filters op de elementaire samenstelling en het belangrijkste pigment dat fytoplankton bevat, namelijk chlorofyl-a. Samen helpen deze metingen ons niet alleen te zien hoeveel fytoplanktonmateriaal er aanwezig is, maar ook hoe hun chemische samenstelling verschilt.

Twee mensen die aan boord zeewatermonsters filteren.

Dedmer Van de Waal (NIOO) en Xiaonan Cai (NIOO) filteren zeewatermonsters aan boord (foto: Yael Artzy-Randrup).

A gloved hand filling up a glass bottle with a tube

Vullen van de SETCOLs met behulp van slangen – en het laat zien hoe de kolom verticaal blijft staan (door Dorien Hoexum, NIOZ)

3 verticale bemonsteringsflessen hangen in frames

SETCOLs klaar om gebruikt te worden, gemaakt in de NMF werkplaats (Photo by Li Zhao, NIOZ)

20 mei - Ruwere wateren tegemoet

Door Melle Versluis (promovendus UvA), Xiaonan Cai (promovendus NIOO) en Amelie Wittig (masterstudent UvA)

We zijn onze expeditie begonnen in tropische wateren, waar iedereen in rustig en zonnig weer kon wennen aan de dagelijkse routines op een onderzoeksschip. Maar omdat we koers zetten richting IJsland, waren we ons er allemaal van bewust dat we niet gedurende de hele reis op zulke kalme omstandigheden konden rekenen. Gisteren maakten we voor het eerst kennis met ruigere zeeën en de hele ervaring veranderde meteen.

Omdat we de voorspelling voor hogere golven van tevoren hadden gezien, pasten we het wetenschappelijke programma hierop aan. Voor ons team betekende dit dat we ons experiment eerder op de dag moesten bemonsteren. Dit houdt in dat we 20L-cubitainers, waarin we water voor onze experimenten incuberen, van de incubatoren aan de voorkant van het schip naar de ultraclean container achterop moeten dragen (waar we onder schone omstandigheden bemonsteren om besmetting te voorkomen), met daartussen twee trappen. We hadden speciale rugzakken meegenomen om dit veilig te kunnen doen, en het is een teamprestatie om 18 cubitainers heen en weer te dragen. Maar in ruwe zee wordt recht lopen bijna onmogelijk, zelfs zonder 20 kg extra gewicht. Daarom haastten we ons om eerder op de dag te bemonsteren en met extra hulp van de bemanning lukte het ons om het sneller te doen dan ooit tevoren. Gelukkig maar, want zodra het zware werk achter de rug was en we ons konden richten op het verwerken van onze monsters in de labcontainers, werd het steeds moeilijker ons evenwicht te bewaren. Voor we het wisten, klampten we ons vast aan een labtafel of leunden we tegen een muur om maar op onze benen te blijven staan. Gelukkig hadden we elk losstaand voorwerp in onze labcontainer ruim van tevoren vastgesjord en verliep de monsterverwerking soepel.

Toen we na een lange werkdag gingen zitten voor het avondeten, werd de coördinatie echter nog lastiger. Op de lange eettafels gleden borden met eten van de ene persoon naar de andere en al snel begonnen zelfs mensen zijwaarts te schuiven terwijl ze op hun stoelen zaten. Je aan de tafel vasthouden en tegelijkertijd proberen om borden en glazen op hun plek te houden, maakte comfortabel eten onmogelijk, en de meesten van ons werkten snel wat eten naar binnen om zo snel mogelijk een stabielere plek op te zoeken. Maar zulke plekken waren nergens meer te vinden; in plaats daarvan moesten we terug naar het lab haasten om de laatste dingen vast te zetten die nog konden bewegen: labstoelen, computerschermen en koelkast- en vriezerdeuren hadden allemaal nog extra spanbanden nodig voordat we de dag konden afsluiten. En zelfs dan is rust moeilijk te vinden als je bij elke golf zijwaarts wordt meegevoerd terwijl je probeert in slaap te vallen…

3 mensen dragen rugzakken met watermonsters over een onderzoeksschip.

Melle Versluis, Xiaonan Cai en Amelie Wittig verplaatsen cubitainers tijdens goed weer. Onder zwaardere omstandigheden waren er geen handen meer vrij om foto’s te maken (foto: Emma Hynes)

18 mei - De stroming volgen: fytoplankton onderzoeken op zee

Geschreven door Emma Hynes (MSc-student 2026 aan de UvA)

Nu we halverwege onze reis zijn, begint mijn groep aan de tweede ronde van onze experimenten. Deze experimenten bestaan uit zogenaamde microkosmossen en, in mijn geval, flowcytometrie, een methode om de verschillende populaties fytoplankton te detecteren en te tellen. We nemen water uit de bovenste waterkolom en laten dat in containers aan boord incideren, zodat we live interacties en veranderingen in de fytoplanktonpopulaties kunnen observeren als reactie op de toevoeging van voedingsstoffen (stikstof, fosfor, ijzer) die de groei van de algen kunnen beperken.

Het tellen van verse monsters is een heel spannende kans, omdat veel eerdere fytoplanktonstudies gebruik maakten van ‘gefixeerde’ monsters. Bij ‘fixeren’ voeg je een fixeermiddel toe (bijv. formaldehyde of glutaaraldehyde), waarna de monsters worden ingevroren en bij -80 °C worden bewaard voor analyse in het laboratorium. Dit is handig omdat we zo monsters kunnen nemen, zelfs als we de flowcytometer niet bij de hand hebben, maar het heeft ook een nadeel. Het fixeren van monsters kan leiden tot verminderde pigment (chlorofyl) fluorescentie, waardoor het moeilijker wordt om alle fytoplanktongroepen te onderscheiden die we waarnemen bij het tellen van verse monsters. Dit geldt met name voor een specifieke groep algen die in warmere wateren voorkomt, en die centraal staat in een aantal van mijn experimenten. Wanneer we aan boord levende monsters gebruiken, kunnen we de volledige samenstelling zien zonder enige afbraak.

Zoals ik in een eerdere blogpost al zei, is ijzer een ‘micro’-voedingsstof die essentieel is voor al het leven, inclusief fytoplankton. Het komt meestal in heel lage concentraties voor (vandaar ‘micro-’ of ‘sporen-’ voedingsstof) en kan in bepaalde delen van de wereldzeeën een flinke beperkende factor zijn. Als we kijken naar hoeveel ijzer er in de voedselarme wateren zit waar we nu zijn, is dat te vergelijken met een paperclip in een olympisch zwembad.

We voeren incubaties uit met 1 liter en 20 liter, en in deze experimenten kijken we vooral welke beperkingen in voedingsstoffen de samenstelling van de populatie beïnvloeden over een periode van 4 dagen. Want net zoals planten mest nodig hebben om te groeien, hebben algen ook voedingsstoffen nodig.

Een aantal doorzichtige incubatiecubitainers van 20 liter (microcosmossen) die in een zeewatertank drijven tijdens incubatie-experimenten aan boord.

Incubatiecubitainers van 20 liter, of microcosmen (foto: NIOZ)

Het leven in container #21

Geschreven door Naomi Bakken (UvA) en Lea Simon (RUG)

Hallo… Wie is daar?

Fytoplankton mag dan wel minuscuul zijn, het behoort tot de belangrijkste organismen in de oceaan. Deze microben vormen de basis van vrijwel elke mariene voedselketen en helpen zelfs het klimaat op aarde te reguleren door kooldioxide op te nemen. Het is daarom van onschatbaar belang om te begrijpen wat hen helpt te gedijen en wat hen bedreigt.

Een grote bedreiging komt van virussen. Wanneer een fytoplanktoncel geïnfecteerd raakt, sterft deze meestal. Overal in de oceanen vinden voortdurend talloze onzichtbare gevechten plaats tussen fytoplankton en virussen, die mariene ecosystemen vormgeven op manieren die we nog maar net beginnen te begrijpen. Deze interactie is precies wat het PHYVIR-project wil onderzoeken.

De uitdaging is dat deze organismen veel te klein zijn om gemakkelijk te zien, zelfs met standaardmicroscopen. Dus in plaats van ze te identificeren op basis van uiterlijk of pigment samenstelling, gebruiken we iets wat wij – de schrijvers van deze blog – veel cooler vinden… hun DNA. Dit is de genetische informatie die de meeste microben hebben en die gebruikt kan worden om ze te identificeren; zie het als een moleculaire vingerafdruk. We filteren een grote hoeveelheid zeewater door een filter, dat we bewaren en meenemen naar het laboratorium. Daar kunnen we het DNA uit het monster extraheren, het sequencen en weer in elkaar puzzelen om te bepalen welk fytoplankton, en met behulp van een ander type filter ook welke virussen, aanwezig waren op onze bemonsteringslocaties.

Maar wat doen ze?

Maar daar houdt het niet op. Weten wie er aanwezig is, is nuttig, maar we willen ook weten wat ze doen. We kunnen dit onderzoeken door te kijken naar een ander molecuul, genaamd RNA. Waarom is dat? RNA geeft ons informatie over welke delen van het DNA op een bepaald moment worden gebruikt. Reacties op veranderende omstandigheden kunnen bijvoorbeeld leiden tot verminderde fotosynthese, ook om hun energie te richten op het reageren op de veroorzaakte stress.

Een virale infectie kan ook als een stressfactor worden beschouwd. Virussen zijn obligate parasieten, wat betekent dat ze afhankelijk zijn van de cellulaire machinerie van hun fytoplankton-gastheren om zich voort te planten. Een deel van deze reproductieve activiteit wordt tijdens de infectie weerspiegeld in het RNA. Aan de hand van deze signalen kunnen we actieve virale infecties identificeren.

We zijn ook geïnteresseerd in fytoplankton-RNA tijdens virale infecties omdat virussen soms de werking van hun gastheren kunnen veranderen, verdergaand dan alleen basisreplicatie. Een virus kan bijvoorbeeld andere voedingsstoffen nodig hebben dan zijn gastheer normaal gesproken gebruikt en kan het RNA van de gastheer beïnvloeden om routes te activeren die de opname van die voedingsstoffen verhogen.

Ten slotte hebben sommige virussen RNA als hun enige genetisch materiaal, wat relatief ongebruikelijk is in de biologie. Hierdoor zijn op DNA gebaseerde methoden niet voldoende om alle aanwezige virussen te detecteren, maar kunnen we toch inzicht krijgen in hun aanwezigheid door RNA te bestuderen. De analyse van virale genexpressie (inclusief RNA-virussen) zal worden uitgevoerd in samenwerking met anderen in het PHYVIR-project.

Twee onderzoekers in een laboratorium aan boord van een schip die monsters sorteren en verwerken om de besmettingsroutes tussen micro-organismen op zee in kaart te brengen.

Sorteren: in kaart brengen wie wie besmet (foto: Dorien Hoexum - NIOZ)

Waar werken we?

We werken samen in lab container 21, wat precies is wat het zegt: een omgebouwde zeecontainer die is ingericht als laboratorium. Het is handig om aparte containers te hebben voor verschillende soorten onderzoek, omdat de omstandigheden binnenin zorgvuldig kunnen worden geregeld. We passen bijvoorbeeld elke dag de temperatuur aan aan die van het zeewater, zodat de microben zo min mogelijk stress ervaren wanneer we ze naar binnen halen.

We moeten schoon werken om besmetting te voorkomen. Dit kan een uitdaging zijn, vooral wanneer apparatuur zoals filtersystemen kan lekken, maar er zijn strategieën om hiermee om te gaan. De belangrijkste bronnen van besmetting waar we ons zorgen over maken, zijn enzymen die RNasen en DNasen worden genoemd, die het RNA en DNA dat we verzamelen afbreken. Deze enzymen komen overal in onze omgeving voor: in zeewater, op onze huid en op laboratoriumtafels. Daardoor besteden we veel tijd aan schoonmaken. Het dragen van handschoenen is een must.

Het doel is om te voorkomen dat onze monsters worden besmet met genetisch materiaal uit onze omgeving, inclusief ons eigen materiaal.

Witte laboratoriumcontainer 21, gezien vanaf de buitenkant aan boord van het onderzoeksschip Anna Weber - van Bosse.

Laboratoriumcontainer 21 aan boord van de RV Anna Weber - van Bosse (foto: NIOZ)

13 mei - Afluisteren van de chemische taal van mariene micro-organismen

Geschreven door Guy Schleyer, NIOZ

Een groot voordeel van een (nieuw) groot schip is dat we een diverse groep wetenschappers met elkaar aanvullende expertise en interesses aan boord kunnen nemen. Samen bestuderen we zowel het fytoplankton in het water als de omgeving waarin het leeft en sterft. Elk team van wetenschappers is verantwoordelijk voor verschillende metingen en analyses – sommige worden live uitgevoerd met speciale instrumenten aan boord, maar voor veel andere is apparatuur nodig die alleen in onze thuisinstituten beschikbaar is. We verzamelen allemaal monsters. Heel veel monsters.

Chemische communicatie op zee

Zeewater bevat niet alleen micro-organismen in grote hoeveelheden, maar ook veel chemische stoffen die ze tijdens hun bestaan produceren, verbruiken en verwerken. Samen zorgen mariene micro-organismen voor de kringloop van enorme hoeveelheden koolstof en andere voedingsstoffen (zoals stikstof en fosfor). Deze chemische stoffen, ook wel ‘metabolieten’ genoemd, worden bovendien door micro-organismen gebruikt om met elkaar te communiceren. Door te luisteren naar deze grotendeels onbekende ‘chemische taal’ van mariene micro-organismen, krijgen we inzicht in hun fysiologische toestand en de ingewikkelde relaties die ze met elkaar hebben.

Een onderzoeker die in een laboratorium zeewatermonsters filtert met behulp van glazen filterapparatuur en bruine monsterflesjes.

Zeewater filteren om micro-organismen en micro-organismevrij water te verzamelen (foto: NIOZ)

Het bestuderen van metabolieten van micro-organismen op zee is echter een uitdaging: de hoeveelheden kunnen minuscuul zijn en sommige worden zo snel verwerkt dat het moeilijk is ze te vangen. Bovendien kunnen de zouten uit het zeewater de instrumenten die voor de analyse worden gebruikt, beschadigen. Hoe verzamelen en bestuderen we deze metabolieten dan? Eerst halen we alle micro-organismen uit het zeewater met behulp van verschillende filters. Vervolgens vullen we dit micro-organismevrije zeewater in speciale cartridges die metabolieten opvangen terwijl het zout erdoorheen gaat. Zo kunnen we metabolieten uit grote hoeveelheden zeewater verzamelen en concentreren. Zodra de cartridges vol zitten met metabolieten, kunnen we ze met chemische oplosmiddelen vrijmaken, drogen en bewaren totdat ze in het thuislaboratorium worden geanalyseerd. En natuurlijk gebeurt dit allemaal op een veilige manier – we willen niet dat er glas breekt terwijl het schip vaart.

Ons team begint de dag met twee containers van 20 liter zeewater en sluit de dag af met 50 verschillende monsters die ingevroren worden bewaard totdat ze in het lab kunnen worden geanalyseerd. Met meer dan 20 stations komt dat neer op heel wat monsters die ons zeker bezig zullen houden in de maanden nadat het schip terugkeert naar Texel om te lossen.

Laboratoriumopstelling met glazen flessen, slangen en patronen voor het filteren en verzamelen van metabolieten uit zeewater.

Het opvangen van metabolieten uit zeewater met behulp van speciale patronen en een veilige opstelling. Het water stroomt vanuit de glazen flessen door de patronen (foto: NIOZ)

10 mei - De perfecte omstandigheden creëren

Geschreven door Jitske Luttikholt (HBO-student) & Amelie Wittig (MSc-student Universiteit van Amsterdam)

We zijn inmiddels goed ingewerkt in onze dagelijkse routines aan boord. Vroeg opstaan, chagrijnig of niet, en nadat we onze veiligheidsschoenen en helm hebben aangetrokken, worden we soms getrakteerd op een prachtige zonsopgang boven de zee. Zodra we de eerste watermonsters van de dag hebben ontvangen, beginnen we met onze tests (incubaties om groei- en sterftecijfers te meten). We hebben ons inmiddels aangepast aan onze routines met betrekking tot de organismen waarmee we werken. Tijdens de experimenten werken we op het schip met levende algen, bacteriën en virussen, dus we willen dat ze zich zo goed mogelijk voelen. De lichtomstandigheden op de verschillende dieptes waar we monsters nemen, variëren en nemen logischerwijs af naarmate we dieper in de waterkolom komen. Om voldoende voedingsstoffen (stikstof en fosfor) binnen te krijgen in het huidige voedselarme oppervlaktewater van de oceaan, houden de algen zich iets dieper op, waar ze nog toegang hebben tot de hogere concentraties voedingsstoffen uit het diepere water. Maar algen hebben licht nodig (voor fotosynthese) en kunnen daarom niet te diep gaan. Daarom zie je een verhoogde concentratie chlorofyl (een belangrijk pigment voor algen) tussen 50 en 100 m, het zogenaamde diepe chlorofylmaximum (DCM). Daar hebben de algen heel weinig licht, maar ze zijn eraan aangepast. Om te voorkomen dat ze worden blootgesteld aan fel daglicht wanneer ze naar de oppervlakte worden gehaald – wat stress veroorzaakt en onze experimenten beïnvloedt – beschermen we deze eencellige algen tegen “verbranding” door te fel licht, net zoals wij onszelf tegen de zon beschermen met zonnebrandcrème en hoeden.

Dit begint al bij het halen van het water: het wordt uit de CTD-bemonsteringsflessen overgeheveld in containers die zijn omwikkeld met meerdere lagen donkere zakken (die regelmatig worden vernieuwd). Ten tweede wordt het licht in onze laboratoriumcontainer gedimd, waarbij de ramen en lampen zoveel mogelijk worden afgedekt. Vervolgens bereiden we voor wat nodig is: we filteren virussen en grazers (roofdieren) eruit, om het fytoplankton te verdunnen en te kijken hoe verminderde sterfte de algengroei beïnvloedt. We maken flessen klaar die in een incubator op het dek worden geplaatst. Om de flessen daarheen te brengen, gebruiken we rugzakken die het licht zoveel mogelijk tegenhouden. Hierdoor voelen we ons net bergbeklimmers, terwijl we over het dek klauteren en verschillende trappen opklimmen om de andere kant van het schip te bereiken. Daar gebruiken we een afdekking terwijl we de flessen op een wiel in de incubator plaatsen, die voorzien is van schermen om de natuurlijke lichtomstandigheden (op de diepte waar ze bemonsterd zijn) na te bootsen. Na deze routine kunnen de algen tijdens onze experimenten prima overleven, en hopelijk krijgen we een aantal fascinerende resultaten!

Links zie je twee jonge vrouwen in witte laboratoriumjassen die apparatuur schoonmaken, rechts zie je een onderzoeker met blauwe handschoenen die monsters in een grote waterbak doet

Het schoonmaken van de apparatuur (fotolinks door Dorien Hoeksum) Om onze monsters in de incubator te plaatsen, moeten ze worden afgeschermd voor de zon (foto rechts door Dorien Hoeksum)

10 mei - Trechters op 5 kilometer diepte

Geschreven door Dorien Hoexum, promovendus bij NIOZ en UU

Loslaten is niet makkelijk

Vorig jaar heb ik voor mijn promotieonderzoek drie grote trechters aan een verankeringslijn in de Atlantische Oceaan geplaatst. Nu is het tijd om ze op te halen en te kijken welke voedingsstoffen naar de bodem van de oceaan zakken. De trechters liggen langs de route van de PHYVIR-expeditie, waardoor ik als enige geoloog mee kan doen aan dit algenavontuur!

Het ophalen van de trechters begint met ze op te sporen. Alle drie zijn ze verbonden met een lange kabel, vastgemaakt aan een ijzeren blok op de zeebodem dat 800 kilo weegt. Eerst stuurt de dekbemanning een signaal naar de kabel, zodat die zich losmaakt van het blok. We zouden precies op de plek van de trechters moeten zijn, maar het terugkomende signaal komt van meer dan 12 kilometer verderop! Als je apparatuur langer dan een jaar op de zeebodem laat liggen, kan er natuurlijk van alles misgaan. Zitten de trechters nog vast aan het verankeringsblok? Zijn ze door de stroming verplaatst? Gelukkig heeft de bemanning van de RV Anna Weber-van Bosse veel ervaring met dit soort klussen!

De dekbemanning van het onderzoeksschip haalt met een dekkraan een groot oranje baken uit het water Deck crew of research vessel collects large orange beacon with a deck crane

Bemanning haalt het oranje baken binnen dat aan de trechter zit (foto: Dorien Hoexum/NIOZ)

Naast het onderzoeksschip verschijnt een grote trechter boven het zeewater

De trechter komt aan de oppervlakte (foto: Dorien Hoexum/NIOZ)

Een goed geoliede machine

Zodra we op de plek van het signaal aankomen, krijg ik een e-mail van het baken. Dit werkt alleen als het boven water is, wat betekent dat het losmaken gelukt is! Als we vanaf de brug uitkijken, zien we na een tijdje de oranje boei, zodat de bemanning kan beginnen met het binnenhalen van de trechters. Het wordt meteen duidelijk dat ik de enige ben die hier nerveus over is: de bemanning pakt het aan als een geoliede machine. Het kost de hele ochtend om de trechters aan boord te krijgen: ze bevonden zich op 1500, 3500 en 5000 kilometer onder zeeniveau, wat betekent dat er heel veel kabel moet worden binnengehaald.

Bemanning haalt een trechter binnen aan boord van het onderzoekschip

Bemanning haalt een trechter binnen (foto: Dorien Hoexum/NIOZ)

Steek je mouwen maar op (of misschien ook niet)

Nu de trechters aan dek staan, is het tijd voor mij om aan de slag te gaan. Het schip blijft nog even op zijn plek liggen zodat de biologen hun werk kunnen doen, wat voor mij best handig is. In de volle zon werken in een regenpak klinkt misschien vreemd, maar het is wel het veiligst. Elke trechter heeft 12 flessen, één voor elke maand, waarin ze alles verzamelen wat in het water naar beneden zinkt. Elke fles bevat een beetje kwik, om alles wat in deze monsters leeft te doden. Ik ben tenslotte geoloog: ik ben alleen geïnteresseerd in de chemische samenstelling van het materiaal. Zodra ik alle flessen heb gesloten en schoongemaakt, worden ze in de koelkast bewaard, zodat ik ze kan analyseren zodra ik terug ben in het lab.

Een onderzoeker neemt monsters uit een trechter terwijl ze beschermende kleding en handschoenen draagt

Dorien Hoexum verzamelt de watermonsters (foto: Dorien Hoexum/NIOZ)

8 mei - De zee in, nog voor het ontbijt!

Geschreven door Jasmin Stimpfle (marien bioloog, Alfred Wegener Instituut), Thomas Cupido (masterstudent, RUG), Melle Versluis (PhD-kandidaat bij Phyvir, UvA) en Yael Artzy-Randrup (universitair docent, UvA)

Nu we afscheid hebben genomen van het laatste stukje land dat we de komende maand zullen zien en officieel internationale wateren zijn binnengevaren, kan het echte avontuur beginnen: watermonsters verzamelen uit de diepten van de oceaan.

Elke ochtend om 5 uur worden we zachtjes wakker gerommeld door de boegschroeven van het schip. Ze houden het schip perfect stabiel, zodat we kunnen beginnen met bemonsteren met het Ultra-Clean CTD (UCC)-systeem, waarmee we zeewater kunnen verzamelen op verschillende dieptes (tot in de diepzee!). Wij, het UCC-team (Jasmin, Thomas, Melle en Yael), gaan naar de kleedkamer, trekken onze veiligheidslaarzen en helmen aan en verzamelen ons op het dek. De dekbemanning is er al.

Even is alles rustig. De oceaan is nog donker en eindeloos, terwijl de lucht om ons heen langzaam roze en oranje kleurt. We krijgen een spectaculair uitzicht voordat het allemaal begint. De bemanning laat de UCC in het water zakken, een zwaar frame dat meer dan een halve ton weegt.

Zeewaardige onderoeksapparatuur wordt in de vroege ochtendschemering overboord van een schip gezet

Ultra clean CTD in vroege morgen (foto: NIOZ)

Op verkenning in de diepte

Zodra de UCC onder de golven verdwijnt, beginnen de sensoren met het meten van temperatuur, zoutgehalte, waterdichtheid, chlorofylfluorescentie (een indicator voor de algen in het zeewater), zuurstofconcentratie en nog veel meer, waardoor een verticaal profiel van de oceaan onder ons ontstaat. Onze hoofdwetenschapper, Corina, houdt de binnenkomende gegevens nauwlettend in de gaten terwijl het profiel in realtime op haar scherm verschijnt.

Terwijl het instrument door de waterkolom omhoog komt, bepaalt Corina precies op welke dieptes er zeewatermonsters worden genomen. Ondertussen schrobben twee van ons de cleanroom schoon waar de monsters later verwerkt zullen worden. Zodra de UCC weer aan de oppervlakte komt, gaat het snel. Het instrument wordt overgebracht naar onze cleanroom-laboratoriumcontainer, uitgerust met een luchtfiltersysteem dat is ontworpen om verontreiniging buiten te houden. Hier wachten we al in volledige cleanroom-uitrusting: overall, haarnetjes en rubberen laarzen, ergens tussen een ziekenhuis-ER en een low-budget ruimtemissie in.

Drie mensen kijken naar een computerscherm waarop binnenkomende gegevens worden weergegeven

De binnenkomende data worden bestudeerd terwijl het profiel in realtime op het scherm verschijnt (Foto: NIOZ)

Zwaar metaal in de cleanroom

Een verontreiniging waar we extra hard ons best op doen om te vermijden, is ijzer. De micro-organismen die we hier bestuderen, komen uit omgevingen die extreem ijzerarm zijn, dus zelfs de kleinste sporen van ijzerverontreiniging kunnen de experimenten beïnvloeden. Dat betekent dat alles uiterst schoon moet blijven: geen slordigheden, geen rondzwevend stof en geen roestige apparatuur in de buurt van de monsters. Zelfs het frame van de UCC is van titanium gemaakt om verontreiniging door sporenmetalen tijdens het verzamelen van zeewater tot een minimum te beperken. Toch klinkt er, terwijl de zeewatermonsters worden verwerkt, vrolijke rock- en light metal-muziek tegen de wanden van de container. Tussen de steriele pakken, de gefilterde lucht en de zware gitaarriffs is er in de cleanroom een heel bijzondere sfeer ontstaan.

Zodra elke monsterfles gevuld is, brengt het UCC-team deze naar de kleine gang in de UCC-container, waar hij door een ander toegewijd lid van de wetenschappelijke groep aan boord wordt meegenomen. Ze delen de watermonsters uit aan verschillende onderzoeksgroepen die geduldig in de rij buiten de container staan te wachten. Iedereen staat te popelen om verschillende parameters te gaan meten of incubatie-experimenten op te zetten (daarover later meer in toekomstige posts). Het is een zorgvuldig gecoördineerde operatie en elk team is voor zijn werk afhankelijk van deze monsters. Tegen de tijd dat de laatste flessen zijn overhandigd, zijn we net op tijd voor het ontbijt (het programma is zorgvuldig gepland om ervoor te zorgen dat iedereen op tijd kan eten).

Vier mensen met beschermende kleding wachten in een laboratorium container

Het cleanroom UCC team (foto: NIOZ)

Een sinaasappel per dag houdt scheurbuik weg

Het ontbijt bestaat altijd uit eieren (bijvoorbeeld een verse omelet), havermoutpap en daarnaast zijn er soms pannenkoeken en gesneden fruit – en dat allemaal midden op de oceaan. En hoewel we proberen de verse sinaasappels niet al te vroeg in de reis op te maken, blijft het moreel hoog en scheurbuik op afstand.

Meteen na het ontbijt gaat de UCC weer naar beneden voor een tweede ronde bemonstering, zodat alle teams alles kunnen verzamelen wat ze nodig hebben. Tegen de tijd dat we klaar zijn met de verwerking van de tweede bemonstering en eindelijk de labcontainer uitstappen, kijkt een van ons op de klok. Het is pas 10 uur 's ochtends…

Onderzoeksapparatuur wordt naar een container op het dek van een onderzoeksschip verplaatst

Het UCC apaaraat wordt in de cleanroom lab container gebracht. (foto: NIOZ)

3 mei - Zorg dat je zeebenen er klaar voor zijn voor een veiligheidsoefening!

Geschreven door Eva Hekma

Vliegende vissen en wankele zeebenen

Gisteren zijn we de haven uitgevaren. Terwijl de kustlijn langzaam uit het zicht verdween en de golven hoger werden, stonden we allemaal op het dek te kijken naar vliegende vissen die vlak naast het schip uit het water schoten. Niet iedereen genoot echter alleen maar van het uitzicht. Veel onderzoekers moesten nog hun zeebenen vinden. Gelukkig zag het er vanochtend al heel anders uit.

Alle apparatuur is vastgezet voor de eerste golf

Gelukkig zag het er vanochtend al heel anders uit. Tegen de ochtend hadden de meeste mensen hun evenwicht gevonden en kon het echte werk beginnen. Werken op zee brengt net iets meer veiligheidsmaatregelen met zich mee dan werken op het land. Voordat we vertrokken, hadden we al onze laboratoriumapparatuur en kratten vastgezet om te voorkomen dat ons lab bij de eerste fatsoenlijke golf plotseling zou besluiten om zijn eigen onderzoek te doen.

Zeven korte en één lange

Na bijna een dag op zee was het tijd voor onze eerste veiligheidsoefening. Iedereen was druk bezig met de voorbereidingen voor onze eerste watermonsters toen we ons werk onderbraken. De scheepstoeter liet zeven korte tonen horen, gevolgd door één lange, terwijl de alarmsystemen binnen meededen met luide, onmiskenbare piepjes. Dat signaal betekent maar één ding: meld je bij het verzamelpunt, de aangewezen plek op het dek. In het begin ging dat niet helemaal soepel. Een groot deel van de groep stond enthousiast klaar, maar op de verkeerde plek. Gelukkig is dat precies waarom je oefent.

Overleven op zee in de praktijk

Toen iedereen eindelijk de juiste plek had gevonden, legde de bemanning uit wat we moesten doen als we ooit echt het schip zouden moeten verlaten. Gelukkig was veel hiervan al bekend dankzij de overlevingstraining op zee die we van tevoren hadden gevolgd. De specifieke procedures voor dit schip werden nog eens doorgenomen, maar het was allemaal een opfrisser. Met de veiligheid weer vers in ons geheugen en onze zeebenen eindelijk gevonden, waren we klaar om vol vertrouwen weer aan het werk te gaan.

Een bemanningslid in een feloranje reddingspak staat op het dek van het onderzoeksschip Anna Weber-van Bosse en poseert met een reddingsboei naast gestapelde vlotcontainers, met de open zee op de achtergrond.

Oefening voor het verlaten van het schip: overlevingspak aan en direct naar het reddingsvlot. De reddingsboei is voor de lol.

2 mei - We zijn klaar om uit te varen, maar we moeten nog even geduld hebben

Geschreven door Dedmer van de Waal

Aankomst

Daar lag ze dan, de RV Anna Weber-van Bosse, het nieuwste onderzoeksschip van de Nederlandse wetenschappelijke vloot. Na een vlucht van zeven uur vanuit Amsterdam kwamen we op donderdag 30 april aan in het tropische Mindelo, de hoofdstad van het eiland São Vicente in Kaapverdië, voor de Afrikaanse kust. Nadat we door de douane waren gegaan in de internationale haven (nou ja, we verlaten het land meteen weer na aankomst), konden we aan boord gaan. Daar maakten we kennis met ons gloednieuwe thuis voor de komende vier weken.

Wie zit er aan boord?

We zijn een diverse groep bestaande uit senior onderzoekers, onderzoeksassistenten, postdocs, promovendi en studenten van verschillende universiteiten en hogescholen. In totaal is ons wetenschappelijk team een bonte mix van 22 mensen uit 7 landen. We worden vergezeld door de 15-koppige bemanning van het schip, die er met hun bekwame handen voor zorgt dat we kunnen varen, eten en ons onderzoek kunnen uitvoeren.

Laboratorium op zee

Voor ons onderzoek hebben we laboratoria nodig waar we watermonsters kunnen verwerken. Er zijn drie vaste laboratoriumruimtes aan boord, maar dat is niet genoeg. Daarom hebben we ook containers die zijn ingericht volgens de wensen van de onderzoekers. Zo zijn er bijvoorbeeld labs die zijn uitgerust om watermonsters te filteren. Het zwevende materiaal (zoals plankton) blijft achter op de filters, die we vervolgens kunnen analyseren. Hiermee meten we bijvoorbeeld de totale hoeveelheid algen in het water. We gebruiken de filters ook om het DNA te analyseren, zodat we kunnen zien welke algen en virussen er in het water zitten.

O jee, vertraging…

Terwijl we druk bezig waren met het inrichten van de laboratoria, kregen we te horen dat we nog niet konden vertrekken. Een aantal formaliteiten had voor vertraging gezorgd, terwijl 1 mei een feestdag is op Kaapverdië. Het voordeel voor ons onderzoeksteam was echter dat we alles konden opzetten en goed konden vastzetten in het rustige water van de haven. Want de laboratoria op zee… die gaan straks met de golven mee!

maar we zijn vertrokken!

Het is zover; we kunnen uitvaren! Op zaterdag 2 mei kregen we te horen dat we toestemming hadden om uit te varen. Nadat we de steiger hadden losgemaakt, voeren we richting de havenmonding, de Atlantische Oceaan op en het echte begin van ons avontuur.