Stage Mariene virale ecologie

Virussen zijn in aantallen de meest voorkomende organismen in de oceanen. Aangezien microben meer dan 97% van de biomassa in de oceanen vormen, zijn micro-organismen de belangrijkste gastheren die deze virussen produceren. Het is aangetoond dat virussen veel verschillende prokaryoten (bacteriën en archaea) en eukaryotisch fytoplankton infecteren. Virussen zorgen ervoor dat voedingsstoffen en organische koolstof uit de gastheer vrijkomen in de waterkolom, waardoor ze invloed hebben op de biogeochemische kringloop en de efficiëntie van de biologische pomp. De invloed van virussen op microben, ook in relatie tot begrazing, hangt af van de abiotische en biotische omgeving. Aangezien dit proces in twee richtingen werkt, wordt de virale component van het mariene microbiële voedselweb beschouwd als een belangrijk feedbacksysteem in klimaatveranderingsprocessen.

In het NIOZ Mariene Virale Ecologie-lab bestuderen we het ecologische belang van aquatische virussen: hun impact op de dynamiek van gastheerpopulaties, biodiversiteit en biogeochemische cycli. We meten bijvoorbeeld virale lyse-percentages in het veld en de eerste gegevens tonen aan dat virale lyse een belangrijke sterftefactor is voor fytoplankton en bacteriën. Deze sterfte kan even hoog zijn als sterfte door grazen. We vertalen onze bevindingen naar biogeochemische fluxen (C, N, P) om te begrijpen hoe virale activiteit de structuur en efficiëntie van het voedselweb beïnvloedt. Ons onderzoek brengt ons naar zeeën en oceanen over de hele wereld, van de Noordzee tot de Atlantische Oceaan en zowel de Noord- als de Zuidpool.

We bestuderen ook de interactie tussen mariene virussen en hun gastheren in relatie tot hun omgeving. We isoleren en kweken nieuwe virussen (en hun gastheer), karakteriseren ze met standaard virologische en moleculaire methoden en gebruiken het virus-gastheer-modelsysteem voor experimentele studies. Een belangrijk aandachtspunt is de invloed van omgevingsfactoren zoals temperatuur, voedingsstoffen en CO2 op de productie van deze virussen. We richten ons ook op verschillende factoren die van invloed kunnen zijn op de overleving van virussen en daarmee direct van invloed zijn op de impact die virussen hebben op hun omgeving.

Als je geïnteresseerd bent om samen met ons aan dit fascinerende onderzoeksonderwerp te werken, ben je van harte welkom om de mogelijkheden te komen bespreken. Je kunt met veel verschillende laboratoriumtechnieken werken, zoals het kweken van fytoplankton, bacteriën en hun virussen, flowcytometrie, (epifluorescentie)microscopie, PAM-fluorometrie en moleculaire technieken. Projecten (bij voorkeur minimaal zes maanden) kunnen het hele jaar door van start gaan. Deze stage is primair gericht op masterstudenten, maar ook studenten van andere studieniveaus kunnen contact opnemen.

Neem voor meer informatie of om te solliciteren contact op met prof. dr. Corina Brussaard: